CircosVCF: Circos Visualization of whole-genome sequence variations stored in VCF files

E. Drori, D. Levy, P. Smirin-Yosef, O. Rahimi, M. Salmon-Divon

פרסום מחקרי: פרסום בכתב עתמאמרביקורת עמיתים

25 ציטוטים ‏(Scopus)

תקציר

Visualization of whole-genomic variations in a meaningful manner assists researchers in gaining new insights into the underlying data, especially when it comes in the context of whole genome comparisons. CircosVCF is a web based visualization tool for genome-wide variant data described in VCF files, using circos plots. The user friendly interface of CircosVCF supports an interactive design of the circles in the plot, and the integration of additional information such as experimental data or annotations. The provided visualization capabilities give a broad overview of the genomic relationships between genomes, and allow identification of specific meaningful SNPs regions.

שפה מקוריתאנגלית
עמודים (מ-עד)1392-1393
מספר עמודים2
כתב עתBioinformatics
כרך33
מספר גיליון9
מזהי עצם דיגיטלי (DOIs)
סטטוס פרסוםפורסם - 1 מאי 2017

טביעת אצבע

להלן מוצגים תחומי המחקר של הפרסום 'CircosVCF: Circos Visualization of whole-genome sequence variations stored in VCF files'. יחד הם יוצרים טביעת אצבע ייחודית.

פורמט ציטוט ביבליוגרפי