Approximate Hashing for Bioinformatics

Guy Arbitman, Shmuel T. Klein, Pierre Peterlongo, Dana Shapira

نتاج البحث: فصل من :كتاب / تقرير / مؤتمرمنشور من مؤتمرمراجعة النظراء

ملخص

The paper extends ideas from data compression by deduplication to the Bioinformatic field. The specific problems on which we show our approach to be useful are the clustering of a large set of DNA strings and the search for approximate matches of long substrings, both based on the design of what we call an approximate hashing function. The outcome of the new procedure is very similar to the clustering and search results obtained by accurate tools, but in much less time and with less required memory.

اللغة الأصليةالإنجليزيّة
عنوان منشور المضيفImplementation and Application of Automata - 25th International Conference, CIAA 2021, Proceedings
المحررونSebastian Maneth
ناشرSpringer Science and Business Media Deutschland GmbH
الصفحات178-189
عدد الصفحات12
رقم المعيار الدولي للكتب (المطبوع)9783030791209
المعرِّفات الرقمية للأشياء
حالة النشرنُشِر - 2021
الحدث25th International Conference on Implementation and Application of Automata, CIAA 2021 - Virtual, Online
المدة: ١٩ يوليو ٢٠٢١٢٢ يوليو ٢٠٢١

سلسلة المنشورات

الاسمLecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)
مستوى الصوت12803 LNCS
رقم المعيار الدولي للدوريات (المطبوع)0302-9743
رقم المعيار الدولي للدوريات (الإلكتروني)1611-3349

!!Conference

!!Conference25th International Conference on Implementation and Application of Automata, CIAA 2021
المدينةVirtual, Online
المدة١٩/٠٧/٢١٢٢/٠٧/٢١

بصمة

أدرس بدقة موضوعات البحث “Approximate Hashing for Bioinformatics'. فهما يشكلان معًا بصمة فريدة.

قم بذكر هذا